Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD3P84022 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD3P84022 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SMAD3P84022 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD3P84022 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD3P84022 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD3P84022 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD3P84022 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD3P84022 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD3P84022 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SMAD3P84022 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SMAD3P84022 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms