Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMF1P82094 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMF1P82094 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMF1P82094 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMF1P82094 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMF1P82094 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms