Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
RPS29P62273 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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