Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LMO4P61968 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LMO4P61968 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
LMO4P61968 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
LMO4P61968 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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