Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ERVPABLB-1P60509 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms