Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARPC4P59998 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms