Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
DCDC1P59894 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms