Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA3P59666 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms