Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DEFA1P59665 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms