Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EEFSECP57772 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms