Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB25P57735 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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RAB25P57735 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RAB25P57735 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms