Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
EMP1P54849 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
EMP1P54849 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EMP1P54849 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EMP1P54849 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
EMP1P54849 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
EMP1P54849 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
EMP1P54849 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
EMP1P54849 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms