Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATP12AP54707 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms