Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARFIP2P53365 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms