Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ETV1P50549 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ETV1P50549 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms