Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUP153P49790 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUP153P49790 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUP153P49790 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUP153P49790 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP153P49790 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP153P49790 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP153P49790 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP153P49790 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP153P49790 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP153P49790 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NUP153P49790 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUP153P49790 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms