Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TGFBR1P36897 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms