Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HOXD13P35453 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HOXD13P35453 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms