Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PTGER4P35408 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTGER4P35408 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms