Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GTF2E2P29084 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms