Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCAP28676 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCAP28676 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCAP28676 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCAP28676 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GCAP28676 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms