Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CHATP28329 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CHATP28329 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CHATP28329 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CHATP28329 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms