Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ABCD3P28288 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms