Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AMY2BP19961 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms