Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FLT1P17948 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FLT1P17948 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FLT1P17948 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FLT1P17948 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FLT1P17948 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FLT1P17948 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FLT1P17948 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms