Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPI1P17947 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPI1P17947 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPI1P17947 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms