Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXB9P17482 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXB9P17482 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms