Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HOXB3P14651 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXB3P14651 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms