Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CHRNB1P11230 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHRNB1P11230 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms