Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4AP0C0L4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms