Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRCP08575 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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