Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
MGPP08493 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
MGPP08493 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MGPP08493 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
MGPP08493 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
MGPP08493 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
MGPP08493 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms