Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SKAP2O75563 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms