Protein–RNA interactions for Protein: O75340

PDCD6, Programmed cell death protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6O75340 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PDCD6O75340 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms