Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRP5O75197 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRP5O75197 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRP5O75197 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5O75197 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5O75197 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5O75197 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5O75197 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5O75197 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5O75197 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRP5O75197 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms