Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATG13O75143 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATG13O75143 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATG13O75143 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms