Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NOBOXO60393 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NOBOXO60393 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms