Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EDIL3O43854 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms