Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MTSS1O43312 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MTSS1O43312 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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