Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC7A4O43246 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC7A4O43246 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms