Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PSMD3O43242 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms