Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SOCS1O15524 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms