Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
POLRMTO00411 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLRMTO00411 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms