Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC169A6NNP5 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms