Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DBX1A6NMT0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DBX1A6NMT0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DBX1A6NMT0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DBX1A6NMT0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DBX1A6NMT0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DBX1A6NMT0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DBX1A6NMT0 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DBX1A6NMT0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DBX1A6NMT0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DBX1A6NMT0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms