Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
USP17L4A6NCW7 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms