Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS37CA5D8V6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms