Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
CCDC144AA2RUR9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC144AA2RUR9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms