Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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