Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH30

IGHV3-16, Immunoglobulin heavy variable 3-16 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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IGHV3-16A0A0C4DH30 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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IGHV3-16A0A0C4DH30 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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IGHV3-16A0A0C4DH30 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
IGHV3-16A0A0C4DH30 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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